四、病毒优先原则
(1)基础免疫：猪瘟、伪狂犬病、口蹄疫的免疫必须放在最优先考虑免疫，因为这些病发生关系到猪场生死存亡。
(2)关键免疫：因蓝耳病和圆环病毒病引起免疫抑制会导致严重的混合感染，可能造成重大损失，做好该两病免疫非常关键。
(3)重点免疫：为了保护胎儿，母猪重点免疫好乙脑和细小病毒苗;为了预防哺乳仔猪腹泻，产前母猪重点免疫好病毒性腹泻苗;为了预防育肥猪呼吸道综合征，仔猪重点免疫好肺炎支原体苗。
(4)选择免疫：链球菌病、猪丹毒、猪肺疫、大肠杆菌病、副猪嗜血杆菌病，可根据猪场具体发病情况进行选择性免疫。
五、经济性原则
圆环病毒病、支原体肺炎、传染性萎缩性鼻炎等病，感染后发病后会严重影响生长速度、耗料增加，造成较大经济损失，应根据猪场损失情况计算投入产出比，选择合适疫苗进行科学免疫，一般在首次感染前4周或野毒抗体转阳前4周免疫，必要时间隔4周后加强免疫;
试验表明：圆环病毒疫苗试验组比空白对照组料肉比降低0.19，每头猪可多收入76元。
六、季节性原则
有些疾病发生具有季节性，一般在该病流行季节前4周免疫。
(1)蚊虫大量繁殖的夏季前种猪4周(3月份)免疫乙脑苗
(2)高温多湿的夏季(4-9月份)要特别重视链球菌、猪肺疫、猪丹毒免疫。
(3)寒冷冬春季节(10月份到来年4月份)需要加强口蹄疫和病毒性腹泻免疫。采用普免的猪场在每年9月份普免，可考虑在10月份加强1次，尤其强调在来年1月再次加强免疫，否则冷湿天气到来的2-3月份就特别容易发病。
七、阶段性原则
一般在易感染阶段前4周免疫，或在野毒抗体转阳提前4周免疫 ，必要时1个月后要加强免疫，所谓易感染阶段是指大约有5%的猪只出现该病的临床症状时，并检测到该致病原。
