辛院士则与中国著名“杂交水稻之父”袁隆平合作，研究如何应用转基因技术与杂交技术提高水稻产量。据测算，杂交技术可将现有水稻产量再提升5%，如果加上转基因技术则可以再提高5%，使水稻产量提高10%。现在的第二期国家杂交水稻计划亩产可达800至900公斤，以后在第三期中如果加上基因技术可以提升至900至1000公斤。
辛院士在研究中发觉，玉米的光合作用效率比水稻要高，因素是其主管光合作用的基因中比水稻多一个碳分子，如果将玉米的碳4基因注入水稻，有望提高水稻的产量。他说，中国杂交水稻技术全球领先，但杂交实验耗时比较长，要在一代代的配对中觅 找合适的组合。而利用转基因则相对省时、精准。而且，将玉米光合作用基因加来 水稻中，两者都是粮食，最后研发出的水稻对人类是完全安全的。
辛院士的另一项研发是抗病毒水稻，曾成功将中药玉竹基因加入水稻内，用以喂饲鸡只就可预防H5N1禽流感。这项科研尚属实验性质，辛院士说，国内外对转基因作物有多种争议，但是作为科学家来说，转基因技术即便作为技术储备也是必须大力研究的。他认为，公众对转基因不应无故 恐慌，应当持理性态度对待。
