消毒工作是切断疫病传播途径、杀灭或清除存活在猪场内外环境及猪体表病原体的有效办法。口蹄疫病毒属于非囊膜病毒，对外界环境因素和化学消毒药抵抗力很强，对酸性和醛类、卤素类消毒剂敏感。可使用复合醛类、碘制剂、氯制剂等消毒药对栏舍、猪群、环境消毒。
生产上可应用复合醛等消毒液，按1：200-1000的比例稀释，对生活管理区、生产区猪舍内外环境，包括栏舍、场地和用具、器械、排水道、空气以及公、母猪、生长育成猪全身体表(寒冷天气除外)等方面的消毒，还应注意一些卫生死角，如装猪台、污水沟、储水池、食槽、保温箱等场所、设施的消毒。消毒前必须先进行严格的清洗工作，才能达到较好效果。
三、加强免疫接种建立高免猪群
接种疫苗是预防口蹄疫病重要措施，常规打一次疫苗，其有保护力抗体，育肥猪只能维持2个月，母猪只能维持3-4个月，而不是1年，按商品猪5-6个月龄出栏计，需注射口蹄疫疫苗2-3次，母猪1年应注射3次。
四、加强饲养管理提高猪群抵抗力
1、充分重视猪群的饲养管理工作，加强饲料营养，提供猪群不同时期各个阶段的营养需要量，保证免疫系统的正常运转。
2、饲料营养水平和霉菌毒素对猪体免疫功能有很大影响，当猪采食含有霉菌毒素的饲料或饲料中缺乏某种维生素或矿物质时，猪的免疫功能就会降低。
