全基因组选择是现代生物育种中最具代表性的技术之一，相比传统方法，全基因组选择大大提高了育种效率，这主要依赖两方面技术突破，一方面，基因芯片能够挖掘到有育种价值的基因组信息；另一方面，通过运用基因组育种值评估算法，能够高效利用收集的基因组、表型组、系谱等信息，准确评估个体育种值。
由于动物基因组中不同位点携带的有效育种信息含量是不同的，芯片位点设计好坏直接决定了基因组中育种信息的挖掘效率，理论上讲，芯片位点越多、单个位点携带的有效育种信息量越大，芯片能够挖掘的有效育种信息量就越多。常规的分子标记位点基因芯片，每个位点携带的有效育种信息量很少，主要来自与之相连锁的功能突变位点。而且，连锁程度在不同群体、不同世代会发生变化，导致分子标记位点效应不稳定，进而影响了分子标记位点基因芯片的通用性、可持续性，会降低育种效率。
而功能位点基因芯片，在设计时利用了功能基因组研究最新成果，选取直接调控基因表达、蛋白质活性的功能突变，每个位点携带的有效育种信息含量更高，且位点效应不依赖连锁，在不同群体、不同世代中效应稳定、通用性和可持续更好，育种效率更高，是全新一代基因组育种芯片。同时，配合全新的功能位点加权算法KAML，能够更高效利用基因组、表型组和系谱等信息，进一步提高育种值评估准确性和育种效率。
功能位点基因芯片育种优势
功能位点基因芯片应用场景
影子基因在猪功能基因组与育种技术研究方面具有深厚积累，可为客户提供基因组育种整体解决方案，包括功能位点基因芯片设计、制备与检测，基因组育种大数据分析，基因组育种软件与软件开发、表观遗传研究与功能突变位点挖掘等服务。
01 影子基因功能位点基因芯片设计流程
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02 影子基因基因组选种选配大数据处理平台HiBLUP
影子基因拥有自主的基因组育种大数据处理平台HiBLUP，分为核心算法、原型中台、育种软件三大产品模块。为基因组选种选配大数据计算提供了平台和工具。
核心算法不依赖任何第三方软件包，不受任何专利限制，功能涵盖基因组选种、选配全计算环节，能够高效处理百万群体、千万标记育种大数据，育种值评估准确性和数据处理能力优于国际主流工具，适用于高校、科研院所动植物遗传学研究。
原型中台对核心算法产品进行封装，能够方便地与种猪场信息化管理软件对接，提供基因型数据管理和基因组选种选配计算服务，适用于与种猪场生产作业管理系统对接，赋能第三方信息平台基因组选种选配功能。
育种软件可提供种猪场信息化管理与基因组选种选配整体解决方案，功能涵盖种猪场日常生产流程管理、种猪登记、表型数据管理、系谱信息管理、基因组数据管理、育种方案设定、基因组选种选配计算及各种统计报表等，适用于各大育种公司种猪生产、种猪基因组育种、三元商品猪基因组选配生产等管理需求。
03 影子基因猪80K功能位点基因芯片
影子基因自主研发猪80K功能位点基因芯片，芯片位点设计集成了猪基因组研究最新成果，涵盖目前最具代表性且位于猪基因组增强子、启动子、编码区、演化保守区等功能区域的重要功能突变位点。芯片包含8万多个对基因表达、蛋白质活性具有重要作用的功能突变位点。位点分型采用自主精准捕获测序技术，位点分型准确率超99%，检出率超98%。
猪80K功能位点基因芯片试剂盒
猪80K功能位点基因芯片位点密度图
猪80K功能位点基因芯片优势
以上是影子基因功能位点基因芯片育种整体解决方案，影子基因竭诚为您提供专业服务，欢迎各位老师同学垂询。
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CORPORATION
关于影子基因
武汉影子基因科技有限公司成立于2021年，与华中农业大学战略合作，技术实力雄厚，公司致力于基因组育种技术研发与推广应用。
影子基因Yingzi Gene，基因组育种技术引领者，提供基因组育种整体解决方案，包括功能位点基因芯片设计、制备与检测，基因组育种大数据分析、基因组育种软件开发、表观遗传研究与功能突变位点挖掘等服务。公司80%的员工拥有硕士及以上学历，拥有T7高通量测序仪、核酸自动提取工作站、高性能计算集群等平台和设备。
公司官网：www.yingzigene.com
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