耐药菌产生后也在不断进化，抗生素的发展更加剧这一进化过程。到现在，即使是第五代抗生素已经出现，疾病治疗依然存在很多问题。耐药菌的进化总在跑在新一代抗生素前面。再加上耐药菌、抗生素从畜禽转移到人类身上，对人类的安全也是很大的威胁。
(2)大部分抗生素进入机体的第一部位是肠道。在肠道中，微生物菌群经过抗生素的作用后，并不会彻底消失。在一段时间后，它们又会找机会在肠壁上定植，这个时候有害菌很有可能占据优势，当有害菌大规模占领肠壁之后，腹泻、便秘等等肠道麻烦便接踵而至，而这个时候很多猪场会考虑使用“抗腹泻专用”抗生素，大规模抗生素使用后，肠道菌群崩溃随之而来。后果是可想而知的，我们的猪场再一次陷入了疾病与用药的恶性循环当中。
(3)随着人们对食品安全的要求越来越高，养殖场也在考虑如何减少抗生素的使用，追求绿色食品。
5、中国是否可以完全禁止抗生素?
当前，中国的规模化养殖场日趋增多，再加上养殖经济不景气，大量的中小散户要么放弃、要么去大型养殖场谋生。而大公司利用雄厚的经济力量对养殖场进行改造，无论是饲养环境，还是饲料营养，均有不同程度的提高。所以，要想全面禁抗不仅要逐步减少使用和对抗生素的依赖，还要从饲养管理、环境卫生等方面综合治理。
