香港中文大学、华大基因研究院、农业部、中科院等单位合作的“大豆归家”项目,在大豆基因组研究方面获研究成果:“31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和进化筛选模式”,今天在《自然—遗传学》上在线发表。该研究首次对野生大豆和栽培大豆全基因组进行了大规模遗传多态性估量 ,为全球大豆的遗传学研究提供了非常有价值的资源,为大豆种质资源保护和分子育种带来新的科学启发。
研究人员运用新一代测序技术对17株野生大豆和14株栽培大豆进行了全基因组重测序,利用SOAP软件v2.18比对来 大豆的参考基因组上,总共发觉了630多万个单核苷酸多态性位点(SNPs),建立了高密度的分子标记图谱。同时通过SOAPdenovo软件分别对野生大豆和栽培大豆进行组装,从而鉴定出了18万多个两种大豆中获得和缺失变异(PAVs),得来 了在栽培大豆中获得以及丢失的基因。此研究还发觉了大豆基因组不同于其它作物植物的两个显著特点:存在较高程度的基因连锁不平稳 和较高比例的单核苷酸非同义替换/同义替换比例,这提示在大豆育种方面,分子标记育种比基因图位克隆可能会拥有更多的优势。这些发觉为大豆的遗传学研究以及分子育种提供了重要的多态性标记,同时也补充了大豆的基因集,为大豆基因组的进一步研究提供了大量的宝贵数据。
研究人员发觉,生猪价格,与栽培大豆相比,野生大豆有着更高水平的遗传多样性,这掩饰人类的筛选对栽培大豆的遗传多样性产生了很大的影响,导致了狭窄的生物多样性,对可不断种植带来负面影响。而对野生大豆的估量 掩饰,随着野生大豆生存环境的减少,野生大豆的有效群体大小在减少,这掩饰了野生种质资源储存 的重要性和紧迫性。
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