一、气体挥发造成的养分损失
有机肥在腐熟过程中里面的氮会转化为氨气，造成挥发损失，因此在腐熟的时候一定要用无破损的塑料薄膜覆盖严密。并且堆积腐熟时间切不可过长，腐熟完毕后尽快使用。
二、化学反应造成的养分损失
人粪尿和草木灰就是例子。现在仍有不少的菜农为了防止人粪尿引来苍蝇或发出异味就在人粪尿里倒上些草木灰。草木灰是含有大量碳酸钾的，pH值显碱性；而人粪尿属酸性有机肥，所以二者相遇，酸碱中和，养分大量损失。因此，在积肥造肥工作中，应做到人粪尿和草木灰分开来，各自单积、单存、单用，切忌将草木灰倒入有机肥中，同时还要防止草木灰被雨水淋湿。
三、养分随水渗漏而损失
像稻壳粪、鸭粪、牛粪这一类等，老百姓们为了能更容易腐熟会在堆粪上浇水，但是往往由于底下没做好防渗漏的措施而致使营养元素随水渗漏而损失。所以无论是用粪坑或平地上腐熟，下面一定要铺设塑料薄膜阻挡养分随水渗漏，此外洒水一定要适量。
有机肥主要来源于植物和（或）动物，是施于土壤以提供植物营养为其主要功能的含碳物料。经生物物质、动植物废弃物、植物残体加工而来，消除了其中的有毒有害物质，富含大量有益物质，包括：多种有机酸、肽类以及包括氮、磷、钾在内的丰富的营养元素。不仅能为农作物提供全面营养，而且肥效长，可增加和更新土壤有机质，促进微生物繁殖，改善土壤的理化性质和生物活性，是绿色食品生产的主要养分。
天清1号有机肥发酵剂由多种细菌、真菌和放线菌复合而成，有效活菌数含量高，降解能力强，可以快速高效的分解畜禽粪便中各类有机质(蛋白质、纤维素、半纤维素、木质素等)，在生物发酵过程中能够达到升温、除臭、消除病虫害、杂草种子和提高养分的效果。同时能在适宜的条件下，迅速将堆料中矿物质分解矿化，形成简单有机物，利于作物吸收。
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