猪蓝耳病是免疫抑制性疾病，通过直接损害猪免疫系统功能使其发生免疫抑制。影响疫苗的抗体水平导致免疫失败，还能破坏淋巴细胞降低机体免疫力，使得其他疾病有机可乘。造成猪体混合感染。现在很多专家学者指出，只要有猪的地方就有蓝耳病。蓝耳病大多呈隐形混合感染的状态存在。但是当外界环境发生变化就可以诱发该病的爆发。它以强大的致病力和免疫抑制让养猪人“谈蓝色变”。
作为猪场“万病之源”的它，与其他疾病有着千丝万缕的关联。
蓝耳病与猪瘟；我国的半数猪场存在着蓝耳病与猪瘟共同感染现象。
蓝耳的免疫抑制直接导致猪瘟的免疫失败。反过来在猪瘟疫苗免疫效果较差的猪场，蓝耳的流行情况也比较严重。二者相互影响，混合感染导致母猪流产等繁殖障碍现象以及仔猪先天感染导致抵抗力下降。所以临床上要密切注意蓝耳疫苗对猪瘟疫苗的免疫抑制效应。
蓝耳病与圆环病毒病：二者关系密切，狼狈为奸影响猪场生产。当圆环和蓝耳同时感染是，蓝耳病毒可以促进圆环病毒的增值和分布，反之亦然，二者相互促进，共同侵害猪体免疫系统特别是肺泡巨噬细胞。使猪呼吸系统抵抗力下降，从而继发胸膜肺炎放线杆菌、支原体等病原体。临床上二者防控要分清主次，蓝耳病是原发性疾病，圆环病毒病是条件致病性疾病。如果单纯感染圆环且病毒含量低于106PFU/ml时，感染仔猪不会出现圆环病毒病的临床症状。但是如果同时感染了蓝耳病病毒，血液中的圆环病毒就会飞速增长。所以圆环病毒病防控的好坏，决定猪场有多少猪；蓝耳病防控的好坏决定猪场有没有猪。
蓝耳病与腹泻：腹泻是现代规模化养猪场常见的一种多因素疾病。猪瘟、蓝耳、伪狂犬病毒也可以引起腹泻。尤其是产房的腹泻，究其原因首先蓝耳病本身具有破坏消化系统的特性。第二蓝耳病在猪场普遍存在，猪瘟和伪狂犬的免疫效果就不会很理想且三者都会导致发生腹泻。第三蓝耳病可以垂直传播，母猪在带毒的情况下可以通过胎盘直接传给胎儿，导致胎儿仔猪先天带毒，形成先天的免疫抑制，抵抗力低下。只要条件稍有改变就会激发腹泻。产房腹泻问题重要的是预防，所以提高母猪的免疫力是关键。
蓝耳病与猪链球菌、副嗜血杆菌：根据相关研究表明，猪副嗜血杆菌、链球菌的检出率在细菌性疾病中是最高的，二者是环境中常见的条件性致病菌。要是二者在机体中表现成优势菌，说明猪体的抵抗力下降。临床上猪副嗜血杆菌和链球菌常伴随猪蓝耳病继发感染，故被称做蓝耳的“影子病”。混合感染比单独发病的发病率和死亡率都明显增高。所以猪场猪副嗜血杆菌、链球菌等细菌感染压力，仅仅是猪场疾病的冰山一角，只有解决了冰山下面的问题才能从根本上消除细菌病带来的压力。尤其是蓝耳病等重大传染病的控制，提升抵抗力，减少相对的继发感染。
蓝耳病的防控策略：面对当前免疫抑制病的广泛存的情况下，提高猪体免疫力的核心就是解放猪体免疫力。其核心就是有效控制猪场内的蓝耳病、猪瘟、伪狂犬、圆环病毒病和腹泻。蓝耳病就是这些问题核心的核心，要解决它最有效的方法就是免疫接种。在实际生产中防治蓝耳病不仅要选用高效安全的疫苗，进行科学免疫接种，还要做好生物安全工作，加强饲养管理，完善预警监测等其他综合防控措施。
