1、母源抗体干扰
母源抗体的被动免疫对新生仔猪来说十分重要，然而对疫苗的接种也带来一定的影响。免疫程序的关键是排除母源抗体干扰，确定合适的首免日龄。最好选定在仔猪持有的母源抗体不会影响疫苗的免疫效果而又能防御病毒感染的期间，即母源抗体为1：8~64时。如在母源抗体效价尚高时接种疫苗，即会被母源抗体中和掉部分弱毒，阻碍疫苗弱毒的复制，仔猪就不能产生坚强的主动免疫力。
在母源抗体水平高时不宜接种弱毒疫苗。例如，仔猪的猪瘟免疫程序，根据猪瘟母源抗体下降规律，一般采取20~25日龄首免，而有猪瘟病毒感染或受猪瘟病毒威胁的猪场应实行乳前免疫，即在仔猪刚出生就接种猪瘟疫苗，待1小时后才让其吮初乳，在55~60日龄再加强免疫一次。
2、猪场发病史
在制定免疫程序时必须考虑猪场所在地区猪病疫情流行情况和该猪场已发生过什么病、发病日龄、发病频率及发病批次，依此确定疫苗的种类和免疫时机。对于本地区、本场尚未证实发生的新流行疾病，必须证明确实已受到严重威胁时才进行免疫接种。
