易感猪的急性感染通常都表现为亚临床症状，但是大多数组织器官中存在大量病毒。感染后仅有的临床症状是发生繁殖障碍，而且临床上的表现还取决于病毒感染母猪的妊娠阶段，在母猪妊娠30d内感染，主要导致胎儿死亡、重吸收；在母猪妊娠30—50d内感染，主要表现为胎儿木乃伊化；妊娠50 -60d内感染，主要发生流产、产死胎；母猪妊娠70d后感染，一般不引起病害，个别感染母猪产弱仔，这主要是由于怀孕中后期的胎儿的免疫系统逐步完善，感染后可以产生保护性免疫应答。病毒感染对种公猪的生产性能没有影响。
猪细小病毒感染的主要症状表现为母源性繁殖障碍。感染的早期母猪可能重新发情而不分娩，或只产出少数仔猪，或产生死胎、弱仔或木乃伊胎等。当胎儿死亡，死胎连同其内的胎液均被吸收时，唯一可见的外表症状是母猪的腹围减少。当胎猪在怀孕中期或后期死亡时，羊水等液体又被吸收，外观显示的唯一症状是母猪的腹鬧缩小。发生繁殖障碍的母猪除出现流产、死产、产弱仔、木乃伊胎及不孕等现象外，大部分无其他明显临床症状，个别母猪有体温升高、后躯运动不灵活或瘫痪，关节肿大或体表有圆形肿胀等。在一窝仔猪中有木乃伊存在时，可使怀孕期和分娩间隔时间延长，这就易造成同窝外表正常的仔猪的死产。
一般，孕50 -60d感染时多出现死产，怀孕70d感染的母猪则常出现流产症状，而怀孕70d以后感染的母猪则多能正常产仔，但这些仔猪常常有抗体并长期带毒。此外，本病还可引起仔瘦小、弱胎、母猪发情不正常、久配不孕等症状。实验感染的新生仔猪可出现呕吐、下痢等症状。
在青年猪以及较大的种猪中，病毒在分裂旺盛的各种组织（尤其在淋巴组织）内广泛增殖。许多猪不论什么年龄和性别在接触病毒后lOd内都显示短暂的轻度白细胞减少。
母猪繁殖障碍的其他表现还有返情、屡配不孕以及妊娠期、产仔间隔延长等。近几年的研究还发现，猪细小病毒感染与仔猪多系统衰竭综合征的发生存在相关性，常与猪圆环病毒发生混合感染。
