盐酸头孢噻呋注射液为头孢噻呋的临床可应用形式之一，兼具头孢噻呋的优良药理特性和混悬液长效缓释的双重优点。试验证明其有效作用时间可达158小时以上，是一种真正意义的长效制剂，而且抗菌活性强、体内过程优秀、低毒无刺激、制剂高度稳定，在兽医临床多个领域发挥不可替代的作用。
1呼吸道疾病
头孢噻呋首次被FDA批准就是用于牛的呼吸道感染，因为头孢噻呋被吸收后，在肾脏和肺部组织浓度最高，其次为肌肉和脂肪，所以非常适合于治疗动物呼吸系统和和泌尿系统疾病，并且盐酸头孢噻呋在感染组织中药物浓度比正常组织高2-4倍，呈有选择性的集中分布，更能有效的发挥杀菌作用。张继瑜等用头孢噻呋治疗猪的传染性胸膜肺炎，青链霉素作为对照，结果显示盐酸头孢噻呋有效率92.7%，治愈率85.3%，分别比对照组提高21.6%和27.5%。
2仔猪三针保健
因为饲养环境恶劣以及仔猪自身免疫力的缺陷，加上生产环节剪牙、断尾、阉割、打耳洞等对仔猪的身体伤害，产房腹泻、梭菌性肠炎、链球菌感染和断奶后呼吸系统疾病频发，给仔猪的存活率和生长发育造成了严重的影响，因此在恰当的时机给予仔猪药物保护应无争议，“三针保健”即由此而来。
与传统的土霉素相比，盐酸头孢噻呋更具优势，有效血药浓度维持时间更长，不易产生细菌耐药，没有免疫抑制和注射刺激，毒性更低且抗菌活性更强。刘玉洁等通过对比盐酸头孢噻呋和土霉素在仔猪三针保健中的应用效果，结果显示盐酸头孢噻呋组仔猪成活率为96.7%，腹泻率仅2.10%，日增重可达233g，与长效土霉素组成活率87.86%、腹泻率12.82%和日增重201g相比，均有极显著的改善和提高。
1呼吸道疾病
头孢噻呋首次被FDA批准就是用于牛的呼吸道感染，因为头孢噻呋被吸收后，在肾脏和肺部组织浓度最高，其次为肌肉和脂肪，所以非常适合于治疗动物呼吸系统和和泌尿系统疾病，并且盐酸头孢噻呋在感染组织中药物浓度比正常组织高2-4倍，呈有选择性的集中分布，更能有效的发挥杀菌作用。张继瑜等用头孢噻呋治疗猪的传染性胸膜肺炎，青链霉素作为对照，结果显示盐酸头孢噻呋有效率92.7%，治愈率85.3%，分别比对照组提高21.6%和27.5%。
2仔猪三针保健
因为饲养环境恶劣以及仔猪自身免疫力的缺陷，加上生产环节剪牙、断尾、阉割、打耳洞等对仔猪的身体伤害，产房腹泻、梭菌性肠炎、链球菌感染和断奶后呼吸系统疾病频发，给仔猪的存活率和生长发育造成了严重的影响，因此在恰当的时机给予仔猪药物保护应无争议，“三针保健”即由此而来。
与传统的土霉素相比，盐酸头孢噻呋更具优势，有效血药浓度维持时间更长，不易产生细菌耐药，没有免疫抑制和注射刺激，毒性更低且抗菌活性更强。刘玉洁等通过对比盐酸头孢噻呋和土霉素在仔猪三针保健中的应用效果，结果显示盐酸头孢噻呋组仔猪成活率为96.7%，腹泻率仅2.10%，日增重可达233g，与长效土霉素组成活率87.86%、腹泻率12.82%和日增重201g相比，均有极显著的改善和提高。
3奶牛乳房炎
尽管头孢噻呋肌注后在乳汁中的药物浓度极低，但有报道称肌注盐酸头孢噻呋对大肠杆菌（或主要革兰氏阴性菌）引起的严重型临床乳炎非常有效，并且不用弃奶，对于继发性乳炎以及乳房炎引起的全身感染，肌注还是一种理想的选择。
一般情况下，奶牛乳房炎的治疗推荐局部给药，盐酸头孢噻呋对引起乳房炎的停乳链球菌、乳房链球菌、大肠杆菌等优势明显，尤其对耐药性的金黄色葡萄球菌效果显著，为其它药物所不及。泌乳期用药往往要考虑到药物残留，作为一种长效药物盐酸头孢噻呋可能会存在更长的弃奶期，然而严凤等研究发现，因为每日挤奶，牛奶中的盐酸头孢噻呋浓度下降迅速，大概在最后一次用药65-88h后，牛奶样品中头孢噻呋浓度会低于允许限量（0.1μg/ml），因此建议泌乳期盐酸头孢噻呋乳房灌注的弃奶期可以定为72h。
所以从制剂和药理上看，盐酸头孢噻呋为奶牛干乳期乳房保健而生。干乳期乳房灌注长效抗生素，有可能实现隐性乳房炎的彻底根治，冯言言等用临近干乳期体细胞偏高（40-80万/ml）的牛群进行试验，以苄星氯唑西林乳房注入剂作为对照，结果表明试验组在用药后只分离到1株葡萄球菌，而用药前共检出39株敏感菌，对比苄星氯唑西林用药后检出11株，盐酸头孢噻呋明显效果更优，体细胞（SCC）方面则在用药后下降了28.7%，有显著性差异。
4母畜生殖感染
如前所述，头孢噻呋主要经肾脏代谢，在泌尿生殖系统中药物浓度极高，国外曾多次报道其用于奶牛产后急性子宫炎的治疗，Jone R等用2.2mg/kg和1.1mg/kg2个剂量的盐酸头孢噻呋混悬液肌注，生理盐水作为对照，观察对产后14天内患子宫炎奶牛的治疗效果，以阴道不再产生分泌物并且直肠温度小于39.5℃作为治愈标准，结果盐酸头孢噻呋高剂量组治愈率为77%，高于低剂量组的65%和对照组的60%。头孢噻呋无疑也可以用做母猪产后感染的防治，肌注每公斤体重3-5mg，用量小，只需一次注射，抗菌效力强，性价比最高，从此告别母猪围产期频繁用药的老传统。
