发酵中药是中医理论指导下，模拟动物胃肠道环境，以中药或其提取物作为发酵底物，利用优选益生菌种对中药成分进行生物转化，制成的一类新型中药制剂，其本质是中药（小分子）成分、益生菌及其代谢产物的复合物。
传统发酵中药有红曲、淡豆豉、六神曲；现代发酵中药目前报道的有发酵黄芪、发酵银杏叶、发酵大黄、发酵虎杖等。
发酵中药的主要特点及优势
兽药知识|发酵中兽药的主要特点及应用
1、保护中药的活性成分，提高某些中药的利用率改善肠道功能
有利于保护中药中的有效成分，微生物发酵一般是在常温、常压等较为温和的条件下进行的生物转化，对热敏感的芳香类挥发油、维生素等成分发挥更加有效地保护作用。
动物肠道是天然的发酵系统，中药大分子物质需要经过微生物处理转化后才能被吸收利用，发酵中药是模拟了动物肠道菌群对中药的生物转化作用，给药后能被肠道直接吸收利用，同时通过微生物的作用还能除去大分子杂质，提高了中兽药的作用效果，也减轻了菌群失衡肠道对中药的消化压力。
2、产生新的物质和作用功能
发酵过程中产生新物质的主要来源：
A、益生菌的代谢产物：如乳酸、丙酸、丁酸等有机酸，氨基酸、维生素、酶类等
B、中药成分经益生菌转化：如枯草芽孢杆菌发酵三七提取物所得的发酵产物中有人参皂苷
随着发酵过程中新物质的产生伴随着新的功能的出现，而且某些新物质之间也会产生协同作用，加强了发酵中兽药的功能作用。
3、双向发酵，协同增效，减轻某些药物的毒副作用
双向发酵：一方面，经过微生物的生物转化作用能免提高中药药效，另一方面，中药的某些成分又能够促进微生物的生长繁殖，提高其生物活动及代谢产物的含量。
发酵中药开发的着力点主要在两个方面:
一是增强免疫力， 二是改善肠道功能，通过提高动物体的健康程度来提高其生产性能。因此，怎样使用发酵中药类产品才能发挥其最优的作用，我们在此做简单介绍：
(1) 预防用药，未病先防，加入日常用药保健方案中，提高动物体的健康水平；
(2) 疫苗免疫前后应用，可以提高抗体效价，使高抗体水平维持较长时间；
(3) 用于幼小畜禽以及免疫抑制性疾病造成的免疫力低下，病后恢复期，能够提高免疫器官、组织和细胞的功能；
(4) 用于促进幼龄动物肠道菌群的形成和稳定，以及肠道菌群失调所致的腹泻，消瘦减重等；
(5) 用于霉菌毒素中毒的辅助治疗。
与抗生素的联合应用
发酵中药有两种：含有活菌的制剂与无活菌的制剂，因此要根据不同的种类来确定能不能与抗生素联合应用。
含活菌的制剂尽量不要与抗生素同时使用，因为常用的抗生素对绝大部分的益生菌是有杀灭和抑制作用的，可以在不同的时间进行分别投药，发挥各自的作用；无活菌的发酵中药应用起来则要方便的多，只要配伍允许即可联合应用。
总结：
与传统中兽药相比，发酵中兽药在保持原有功能，并且提高疗效的同时，还增加了新的功能，拓宽了临床适用性，根据目前规模化、集约化养殖的发展趋势，以治未病为原则，增强动物生理机能和免疫力，达到提高动物生产性能，使动物不发病或少发病，减少药物使用，提高食品安全，同时也符合目前国内和国际上对绿色饲料添加剂的发展需求，期望其在动物健康养殖中发挥更大的作用。
