一、蓝耳病难以控制的原因
PRRSV基因组的变异是本病难以控制的重要原因之一。根据基因组的序列差异分为两个型，即以ATCCVR-2332（VR株）毒株为代表的美洲型（简称B亚群）和以Lelystadvirus(LV株)为代表的欧洲型（简称A亚群）。毒株之间存在显著的抗原差异性，两者只有很少的交叉反应。同时我国的分离毒株也存在变异现象，现已发现有大量缺失变异毒株的存在。
二、蓝耳病破坏肺部的巨噬细胞
PRRSV的主要靶细胞是单核细胞-巨噬细胞系统如肺泡巨噬细胞、肺泡的二型肺细胞、外周单核细胞、生精小管的上皮生殖细胞和间质内的巨噬细胞，卵巢卵泡中的巨噬细胞。其中猪肺泡巨噬细胞最为敏感。因蓝耳病毒对巨噬细胞，特别是肺泡巨噬细胞有极强的亲嗜性，并在其内大量复制，破坏巨噬细胞而导致免疫抑制。机体自然保护机制的失衡导致细菌性继发感染接踵而至，如副猪嗜血杆菌、链球菌、沙门氏菌、胸膜肺炎放线杆菌、巴氏杆菌及肺炎支原体等。中国99%的猪场蓝耳病呈阳性，蓝耳病在整个呼吸道综合征的发展过程中起到承上启下的作用，防控好蓝耳病是防治呼吸道综合征的重中之重。
三、控制蓝耳病通过两个有效途径：
控制蓝耳病毒的增长；保护肺部的巨噬细胞增强肺部的免疫功能
